Cucerirea Oaxaca a fost relativ pașnică, deoarece domnii Zapotec și Mixtec au crezut că vor găsi la europeni aliații de care aveau nevoie pentru a-i învinge pe azteci.
Pe de altă parte, alte grupuri, cum ar fi zapotecii din Sierra, Chontales și mai ales Mixturile, au rezistat și au realizat o continuare a rebeliunilor. La triumful lor și încă în secolul al XVI-lea, spaniolii i-au dezbrăcat pe nativi de pământurile lor, legalizând această acțiune prin encomiendas, mercedes și diviziuni acordate de rege, subliniind astfel, de la începutul cuceririi spaniole, dezechilibrul și inegalitate care ar prevala între societatea spaniolă și cea indigenă.
Abuzurile comise de colonizatori au fost atât de abundente, încât o bună parte a muncii desfășurate de cei doi Audiencia și vicerege Antonio de Mendoza au vizat limitarea puterii marchizului din Valle de Oaxaca, Hernán Cortés, și a celor de la encomenderos. Ei au propus astfel să consolideze autoritatea regală și de aceea au fost promulgate noile legi (1542) și s-a creat o administrație complexă. Sarcina evanghelizării în zona Mixtec și Zapotec a fost opera ordinii dominicane care a construit, cu lucrări practic indigene, biserici și mănăstiri somptuoase în locurile în care erau concentrate marile centre de populație, precum orașul Antequera, Yanhuitián și Cuilapan. .
Cucerirea spirituală a fost mai radicală și mai violentă decât cea militară. Pentru a menține controlul asupra populației, cuceritorii au menținut, cu modificări, anumite structuri indigene în așa fel încât unii dintre șefii din Valea Oaxaca și din Mixteca Alta au reușit să păstreze vechile privilegii și proprietăți; În schimb, pentru a converti popoarele Americii la creștinism, misionarii s-au străduit să distrugă orice urmă a religiei lumii prehispanice.
În ciuda declinului demografic al populației native, cauzat de epidemii și maltratare, secolul al XVI-lea a fost unul de creștere economică datorită introducerii de noi tehnici, culturi și specii. În Mixteca, de exemplu, s-au obținut profituri bune din exploatarea viermilor de mătase, a bovinelor și a grâului. Dezvoltarea pieței urbane și a minelor a contribuit la această creștere.
Cu toate acestea, această prosperitate a fost întreruptă de problemele cu care s-a confruntat mineritul încă din 1590. Comerțul dintre Sevilla și America a scăzut, iar scăderea populației a determinat scăderea consumului orașelor, iar forța de muncă a fost redusă la expresia sa minimă.
În secolul al XVII-lea, cea a depresiei economice a fost atunci când structurile coloniale au fost definite, schema de dominație a fost consolidată și au fost stabilite mecanismele unei economii dependente. Aplicarea unui monopol și a unui sistem comercial centralizat a împiedicat dezvoltarea economică regională, determinând zone la fel de bogate ca Valea Oaxaca să-și orienteze economia spre autosuficiență, în ciuda importanței producției și comerțului cu cacao, indigo și cochineală. .
Deja în a doua jumătate a secolului al XVII-lea, economia Noii Spanii a început să se îmbunătățească: producția minieră a revenit, schimburile comerciale cu America Centrală și Peru au fost permise din nou, iar populația indigenă a început să-și revină. În acest moment, spaniolii care locuiau în Mixteca și în Valea Oaxaca s-au dedicat creșterii bovinelor în proporții mari, iar haciendas au combinat cu succes producția de grâu și porumb cu creșterea vitelor. Economia colonială a fost restructurată între 1660 și 1692, punând bazele secolului iluminist.
Noua Spanie crește și prosperă în epoca Iluminismului. Teritoriul se dublează, populația se triplează și valoarea producției economice este de șase ori. Cel mai bun exemplu al acestor progrese este observat în minerit, o axă economică centrală care, deși era încă sclavă, a trecut de la a lucra 3.300.000 de pesos în 1670 la 27.000.000 în 1804.
Opulența Noii Spanii se manifestă în activitatea intensă de construcție și se revarsă în măreția barocului, atunci în Antequera au construit, printre altele, Capela Rozariului Bisericii din Santo Domingo, Biserica din Soledad, San Agustín și Consolación.
Secolul al XVIII-lea a fost secolul modernizării reformelor politice și economice întreprinse de regii borboni.
Până în 1800, Mexicul devenise o țară cu o bogăție extraordinară, dar și cu o sărăcie extremă, majoritatea populației era atașată de haciendas și comune, erau maltratați la locul de muncă, înrobiți în mine și fabrici, fără libertate, fără bani. și fără nicio șansă de îmbunătățire.
Spaniolii peninsulari au monopolizat puterea politică și economică; Astfel de condiții de inegalitate socială, economică și politică au acumulat tensiuni și nemulțumiri. Pe de altă parte, impactul unor evenimente precum Revoluția Franceză, independența Statelor Unite și Revoluția Industrială Engleză zguduie conștiințele americane și ideea Independenței Noii Spanii începe să prindă cont în creole.
