Istoria orașului care a fost numit inițial Regatul Noului Galicia continuă.
Există, de asemenea, vechiul colegiu iezuit din Santo Tomás de Aquino, construit în ultimul deceniu al secolului al XVI-lea și care în 1792 a fost ocupat de universitate. Din construcție, rămân doar ceea ce a fost biserica, cu cupola sa monumentală din secolul trecut și capela Loreto atașată, construită în 1695 de Juan María de Salvatierra. Templul San Juan de Dios, care a fost anterior Capela Santa Veracruz, construit în secolul al XVI-lea de Don Pedro Gómez Maraver, a fost construit în secolul al XVIII-lea cu o fațadă barocă cu caracteristici sobre. Biserica La Merced, cu un stil baroc similar cu cel din San Juan de Dios, deși mai ornamentată, a fost fondată în secolul al XVII-lea de către frații Miguel Telmo și Miguel de Albuquerque.
Templul La Soledad a fost construit spre sfârșitul secolului al XVII-lea și începutul secolului al XVIII-lea la cererea Juanei Romana de Torres și a soțului ei, căpitanul Juan Bautista Panduro. În loc se afla frăția Maicii Domnului Solitudinii și Sfântul Mormânt, ocupând o capelă dedicată San Francisco Xavier. Templul și școala din San Diego, lucrare din secolul al XVII-lea; primul cu o ușă foarte sobră care pare deja a aparține stilului neoclasic și al doilea cu o frumoasă arcadă care împodobește vechiul său mănăstire.
Biserica lui Jesús María, atașată mănăstirii cu același nume, a fost fondată în 1722; își păstrează încă fațadele baroce, pe care puteți vedea sculpturi mari reprezentând Sfânta Familie, Fecioara de la Lumină, San Francisco și Santo Domingo.
În cele din urmă, este important să subliniem încă trei construcții religioase care au apărut ca cele mai bune exemple, fiecare de felul său, a dezvoltării arhitecturii coloniale în Guadalajara, în principal între secolele al XVII-lea și al XVIII-lea. Astfel avem capela Aránzazu, de la mijlocul secolului al XVIII-lea, cu clopotnița curioasă și interiorul său decorat cu picturi magnifice și cu altarele churrigueresque din aceeași perioadă și considerate cele mai bune din oraș. Mănăstirea și biserica Santa Mónica, fondată de părintele Feliciano Pimentel în prima jumătate a secolului al XVIII-lea; templul său prezintă o fațadă dublă cu bogate ornamentații clasificate drept cel mai bun exemplu al exuberantului stil baroc salomonic. Templul San Felipe Neri, construit în 1766 de arhitectul Pedro Ciprés, formează un set de sobrietate extraordinară care încorporează elemente cu reminiscențe platerescice în ornamentația sa, aspect care plasează templul drept cea mai bună clădire religioasă din Guadalajara.
În construcțiile care corespund arhitecturii civile, există câteva clădiri admirabile, printre care putem menționa Palatul Guvernului, vechi case regale care au fost modificate în secolul al XVIII-lea în urma unui proiect al inginerului militar Juan Francisco Espino, deși fațada era opera lui Miguel José Conique. Clădirea a fost concepută în esență în stilul baroc, dar anumite tendințe neoclasice sunt deja vizibile în ea. Birourile regale, care se aflau în defunctul Palacio de Medrano, și sălile de audiență funcționau în incintă.
Avem, de asemenea, ceea ce a fost Seminarul Conciliar dedicat lui San José, inaugurat de episcopul Galindo y Chávez în 1701, ocupat astăzi de Muzeul Regional din Guadalajara, cu principalul său mănăstire de coloane în stil toscan și ușile sale baroce. Celebrul Hospicio Cabañas construit la începutul secolului al XIX-lea, urmând planurile ilustrului arhitect Manuel Tolsá, regizând lucrarea José Gutiérrez și finalizat ani mai târziu de arhitectul Gómez Ibarra și care constituie un exemplu notabil al stilului neoclasic.
Printre alte construcții minore care au oferit unitate stilistică orașului Guadalajara, putem menționa, deși nu toate sunt păstrate: conacul impunător din secolul al XVI-lea care se afla în fața a ceea ce a fost odată piața San Sebastián din cartierul Analco. Casa de pe Calle de la Alhóndiga nr. 114, în prezent Pino Suárez. Reședințele care au aparținut familiei Sánchez Leñero la numărul 37 și cea a domnului Dionisio Rodríguez la numărul 133 de pe strada de Alcalde. Casa Calderón, un magazin tradițional de bomboane coloniale fondat în 1729 și situat la colțul străzilor vechi Santa Teresa și Santuario, astăzi Morelos și Pedro Loza; cea a lui Francisco Velarde, într-un stil neoclasic, și în cele din urmă cel care a fost conacul Cañedo, situat în fața din spate a Catedralei.
În vecinătatea Guadalajara, al treilea cel mai important oraș din țară, se află orașul vechi San Juan Bautista Melzquititlán, astăzi San Juan de los Lagos. Acest oraș a devenit un important centru religios datorită marii tradiții miraculoase a imaginii Fecioarei Maria care își păstrează bazilica, construită la mijlocul secolului al XVII-lea de Don Juan Rodríguez Estrada. În același oraș puteți vedea alte clădiri precum Templul Ordinului III, Capela Calvarului, Capela Primului Miracol, datând din secolele XVII și XVIII. Există, de asemenea, clădiri civile importante în populație, precum Palatul Colegiului și clădirea Zecimilor, printre altele.
În orașul Lagos de Moreno puteți vedea parohia sa principală, o operă din secolul al XVII-lea, cu o fațadă frumoasă în stil churrigueresque.
În cele din urmă, în San Pedro Tlaquepaque există câteva exemple de arhitectură religioasă barocă în regiune, cum ar fi parohia San Pedro și Templul Soledad.
